Os seus primeiros trabalhos para tiras de jornal datam de 1977. Em 1980, começou a trabalhar para a Editora Marvel UK, com trabalhos na revista Dr. Who. Além de trabalhar para a Marvel UK, Moore trabalhou também, nessa época, para a revista 2000 AD, da Editora IPC. Mas é em 1982, com a publicação na revista Warrior, da série V de vingança, desenhada pelo seu compatriota David Lloyd, que Alan Moore alcançou a fama que cruzou o Atlântico, levando a editora DC Comics a convidá-lo para trabalhar na famosa série Saga of O Monstro do Pântano, sendo que a primeira história nesta série foi publicada em 1983. Para esta revista, Moore criou o tenebroso personagem John Constantine. Em 1986, para a DC, Alan Moore concebeu Watchmen, maxi-série em 12 edições, desenhada por Dave Gibbons, que constitui uma das mais conhecidas obras dos quadrinhos no mundo. Watchmen consagrou Moore definitivamente na indústria dos comics, sendo considerado um dos melhores argumentistas da atualidade. Alan Moore, além de ser o autor da famosa Piada Mortal, escreveu Do Inferno, sendo também de sua autoria a criação de America’s Best Comics, para a Wildstorm, estúdio de Jim Lee que hoje é um selo da DC Comics.

Moore redefiniu os super-herois juntamente com Frank Miller, os deixando mais maduros com históras mais sérias, pesadas e interessantes. Watchmen foi a primeira história a apresentar um panorama político e as influência dos heróis nesse meio.

Várias obras de Moore já foram adaptadas para o cinema, como "Do Inferno", com Johnny Depp, "A Liga Extraordinária", com Sean Connery, "V de Vingança", com Natalie Porter, "Contantine", com Keanu Reeves, e mais recentemente "Watchmen", dirigido por Zack Snyder.